Para a Microsoft minimizar a entrada de virus pela pen drive desabilitando a função AutoRun dos pen drives, já é conhecido que muitos virus se aproveitam do AutoRun do Windows para se autoexecutar assim que um dispositivo USB é instalado.

A promessa é que já o AutoRun seja um efeito desabilitado nativamente no Windows Seven e que será atualizado no XP e Vista, sendo apenas mantido o AutoRun para Cds e Dvds. Ainda é possivel que o virus infecte os pcs usando a usb só que desabilitando o recurso de AutoRun, você impede que o virus seja executado automáticamente.

Um grande conhecido por se instalar usando as pen drives Conficker que além de mudar seu comportamento e causar uma bagunça na rede, vale a dica de se previnir deste tipo de virus já que surgiu no mercado programas que bloqueiam as usbs e diminuem a chance de pegar virus usando uma pen drive infectada. Outro virus o Ravmon.exe que é muito comum nos tocadores mp3 e mp4 dizem ainda que foi um virus enviado em um IPOD pela Apple que se infectou e causou danos nos Windows.

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